谁也不曾想过，七十年前那期神秘的罗斯威尔事务，时至本日仍对全部人类发生着云云庞大的影响。而且鲜少有人窥见真相的全貌，即便它就在那里。某天，过着颓废生存的前联邦捕快福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）以及他最为相信的同伴——正在某某教会病院担负医师的丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）重新聚在一起。原来一档旨在揭露政治黑幕节目标主持人找到他们，进展二人表露政客行使外星人来掌握人类的真相。以此为契机，关闭已久的X档案重新开启。一度对各类离奇事务落空决心信念的穆德，在斯科莉的陪伴下重新踏上征程。 而这一起上，层层隐藏起来的真相以及人类恐怖的将来，将相继显如今他们的眼前……
