1945年，游学归来的刑侦专家程慈航，在船埠遭遇险情，多方权势为争夺一只铁箱大开杀戒。这只铁箱里，寄存着日军细菌武器的绝密档案。警察厅厅长莫采石将铁箱寄存在了档案馆密屋内，却在夜里档案被盗，案情从此扑朔迷离。程慈航获悉此案事关日军细菌武器，向“叔叔”莫采石请战，总署刑侦警察局局长霍然随即特聘程慈航为平民侦察。程慈航上任后，很快找到千丝万缕，顺藤摸瓜接连捕捉重大线索，然而他却处处受阻，总有人争先一步将相关职员杀人灭口，幕后黑手事实是谁？这个丢失的档案又事实在那里？程慈航事实若何破解迷局，一切尽在谜底尽在《昙花梦》里。
