第41集剧情:朱棣登基为帝 齐泰黄子澄斩首
李景隆带头表态，希望朱棣(冯绍峰 饰)能登上皇帝位，朱棣表面却拒绝了，并且表示要从宗室当中选择有德之士担任国君，随后命令将朱允炆(陈月末 饰)以天子礼厚葬。同时也宣布了朱允炆之所以死都是因为轻信了佞臣，下令捉拿黄子澄和齐泰，如果有收留着都同罪论处。
私底下，朱棣命令马和带领锦衣卫四处寻找朱允炆的踪迹，下令无论朱允炆是生还是死，他此生都不愿意再见，可见朱棣根本就不相信朱允炆死了。朱棣特地找了夏元吉说话，将元朝的地图给他看，探讨将来的远大理想，可是夏元吉却告诉朱棣当时杨广也是那么想的。这让朱棣哭笑不得，夏元吉接着提出了很多的问题，也都说明现在实际存在的问题，还有连年以来百姓因为战争遭遇的苦难，朱棣表示不会大兴土木，且会让百姓收养生息，一番话说出来，才让夏元吉臣服。方孝孺当着朱棣的面，写下了燕贼谋逆四个字，一口鲜血吐出来，喷洒在了纸张之上，这也让朱棣恼怒不已，命人将方孝孺带下去。方孝孺跪在大殿门口对外磕头，似乎是在祭拜朱允炆。朱棣看着方孝孺留下的字冷笑连连，命人将已经捉到的练子宁、齐泰和黄子澄和方孝孺等人，连同家眷一起明日午时在刑场明正典刑。徐妙锦在街上见到了一些无辜的女子被带去了教坊司，而这些人都是黄子澄等人的家眷，徐妙锦惊讶不已，不敢相信这是朱棣所为。徐妙云(颖儿 饰)赶去京城，朱能前来通知徐妙云去见徐妙锦，同时也将朱棣抓住铁铉的事情告诉了姚广孝(王绘春 饰)，姚广孝匆忙赶回去。朱棣听闻铁铉被抓赶紧跑过去，可是铁铉却不愿抬头看朱棣，朱棣心中难过，朱棣觉得当年如果不是铁铉去求朱元璋(陈宝国 饰)，他也不会册立朱允炆为太子，这也是铁铉造成的后果，可是铁铉认为如果不是他那么做的话，恐怕朱允炆连今天都活不到。朱棣希望铁铉来帮他登基，铁铉只是询问朱棣朱标(何晟铭 饰)的帝号是否能保得住？朱棣无语，铁铉知道，如果朱棣保住了朱标的帝号，就担上了谋逆的罪名，所以他不会承认被追封皇帝的朱标。因此铁铉表示自己不能和朱棣继续同路，他也不能对不起朱标。朱棣本不想杀铁铉，但是铁铉却一心求死成全他的忠义之心，朱棣含泪答应了，恰好被赶来的姚广孝看到，他也无计可施。徐妙云来找朱棣，也知道徐妙云今天去了魏国公府中，徐妙云对于朱棣要捉拿的奸党心中痛楚，尤其是徐允恭也在名单之中，朱棣表示自己不会杀了徐允恭，他会将徐允恭幽禁府中闭门思过。徐妙云却并没有谢恩的意思，眼中含着泪光看向朱棣，朱棣告诉徐妙云，今天杀了铁铉，他也准备当皇帝了，既然要做天子，他就要做一个天子应该做的事情。徐妙云心痛自己已经死了一个弟弟，而这一个还要被关在府中，活活的成为一个活死人。徐妙云心痛大哭，朱棣紧紧将徐妙云抱在怀中，答应一定会善待徐增寿的儿子。朱棣不满属下给定的永清年号，还为自己定下年号称为永乐，在朱棣入宫的时候，准备登基为帝，却被夏元吉的徒弟杨子荣给拦住了，提醒朱棣应该先去孝陵再来登基，朱棣恍然大悟，从此也记住了杨子荣。朱棣特意去参拜了朱标，并且承认朱标的皇帝位，但只是无奈表面不能承认，朱棣抱着朱标的牌位放声大哭，心中思念着朱标，可又不得不做对不起朱标的事情。公元1402年，朱棣正式登基为帝，从此也开启了永乐盛世的篇章。夏元吉带人打通了河道两万多丈，用了十二万官民，且用时一年，终于完工了，夏元吉激动不已。好几天没有合眼的夏元吉，刚刚休息了一下，朱棣的圣旨就到了，苏松地区的百姓赋税全免，这让夏元吉更加开心，今年的新科又开始了，朱棣希望夏元吉能回去选拔一些俊才，同时也要求拓宽苏州河道，因此，张大人猜测可能是朱棣要经略海外了，夏元吉一言不发。杨子荣见到夏元吉时候，发现他瘦了不少，可是现在河道通畅，水患减少，他心中愉悦。杨子荣告诉夏元吉朱棣要削藩的事情，但是却温和处之，相比朱允炆的人仰马翻相差数倍，不可同日而语。朱棣还减免了受灾地区的赋税，同时增加了科举名额，还创设了内阁，专门商议国家大事。在杨子荣的口中，朱棣就是一代明君。杨子荣认为朱棣夺位和唐太宗相似，所以他更要立誓做明君，杨子荣也被朱棣更名为杨荣。当夏元吉来找朱棣的时候，却被拦在门外，告知皇帝在里面和朱高煦商议军情，可能今天无法见他了。夏元吉离开的时候碰见了朱能，免不了又是寒暄一番，看着朱能进入大殿，夏元吉感慨漠北二字。
