2599年，人类酝酿了五百年之久的火星移民设计终究要迈出重要一步了。在此之前，科学家通过向火星投放藻类以及甲由以改善火星的生计情况。而今，为了避免死刑的责罚，小町小吉（伊藤贤明 饰）和两小无猜秋田奈奈绪（武井咲 饰）不能不准许本多博士（小栗旬 饰）的要求，与武藤仁（山下智久 饰）、蛭间一郎（山田孝之 饰）、森木明日香（菊地凛子 饰）、堂岛启介（加藤雅也 饰）等有着差别身份和布景的人们踏入前去火星的飞船。抵达目标地后，他们惊讶地发明甲由早已进化成无比健硕高大的生物，而且迅速向他们倡议了进攻。 在战役过程当中，他们领会到这次火星观光的真正目标，因而为了回到地球而拼尽全力与洪水般的甲由人战役……
