位于东京西部的庞大“学园都市”。在总生齿达230万人，此中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特别课程，学生们的能力被给予从“能干力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。 高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一。他因为隐藏在右手中的气力——只有是异能之力，就连神的加护都能消弭的“空想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“能干力”，过着布满不幸的人生。 而上条的学生生存，因为暑假起头时突如其来的纯白修女而产生了庞大的转变。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇起头，上条就被卷入了各类各样的事务中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝联系关系的“魔法”方，在惊险地解决两边事务的过程当中，他的人际关系也逐步扩大。以后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于留意到上条的存在……。 如同照应魔法方一...
