《红色派系：起源》的故事将相沿游戏的布景和人设：自Alec Mason率领火星殖民地重获自由曾经由去了25年，而他的妃耦被杀，女儿Lyra被绑架也过去了12年，Alec自那时起便已是一位破碎的英豪。他剩下的独一的儿子，Jake Mason，如今曾经成为了红派民兵(Red Faction Militia)的军官，当他发明12年前被绑架的妹妹至今还在世时，他的世界被颠覆了。 即便有新的仇敌蜂拥至火星，但Jake依旧决议去寻觅他的妹妹，但他发明Lyra如今却成了敌对权势的一员，一个冷血的兵士，立誓要毁掉红派(Red Faction)。Kate Vernon将饰演The Matriarch，入侵者的族长。
