正在调查坠落在承平洋上的不明飞行物体的海上自卫队二尉有动贵文（大澄贤也），遇到了突然出现的蓝光，受发光体的影响，致使遗传因子尺度的变质，酿成了凶暴的怪兽THE ONE。以后，他（THE ONE）从防卫厅内的特别机关BCST（对生物工程学的研究机关）的监视下逃走，从此就没了音训。 另一方面，航空自卫队F15J飞行员真木舜一（别所哲也），为了多点时候陪伴患有先本性疾病的儿子继梦决议辞去官职。在最初一次飞行中真木与“红色发光体”在空中相遇。这是the one事务后3个月产生的工作。可是真木事业般地生还，然后转职成为了民航机飞行员，睁开了新生活。对这样的真木还是有机关非常关注，尤其是BCST中的化学担任官水原沙罗，BCST将真木强迫带走，在废工场中搭建的BCST研究室进行身体上的监视。此时行踪不明的怪兽THE ONE像被某种工具吸引而回来了。遭受THE ONE进犯而濒死的真木，身体产生了转变，在红色光球的气力之下变身了！酿成身高10M拥有银色毫光的钢铁身体型态，偶而还有自己意志的真木，跟THE ONE睁开作战，可是由于变身不完整，能量快速损耗，在遭到决议性的一击后变回了真木舜一的型态。然后沙罗将这个在THE ONE以后出现的性命体命名为“THE NEXT”。 真木在从东京被护送回BCST研究室的途中得知了儿子继梦入院的动静,在赶到病院后跟妃耦蓉子再次的碰面了。此时,人类最大的危急出现了,在吸收了林林总总的生物进入体内而产生变异的THE ONE重返出如今新宿的街道上,从口中发出的的超绝火炎光弹将街道销毁殆尽有恸的人格曾经被THE ONE庖代,曾经成为不行变回为人的状况。可是那样的有恸之前与水原沙罗倒是有着婚约的情侣为了沙罗心中的回想，而且为了跟儿子继梦的约定，为了珍爱心爱的家族，真木再次变身。那个姿势加倍进化成庞大化40m，在间接部有像流血般的红色，两肘的特征是出现肘刀。如今，以新宿副市中间为舞台，ULTRAMAN与THE ONE的决战之火起头熄灭了！
